Un aspect fondamental du nihonga est également l'inexorabilité de la nature, ses changements continus et leur acceptation. Grâce à des pigments minéraux durables issus de minerais naturels et de coquillages broyés, appliqués sur du papier ou de la soie, le nihonga saisit l'essence de la nature — comme une forêt en transformation perpétuelle — et la fixe sur un support unique.